Bilim din çatışmaları, XIV. Yüzyıldan itibaren Batı Dünyasında bilimlerin yavaş yavaş gelişmeye başlamasıylai Katolik Kilisesi ve Batı pozitif bilim dünyaısı arasında başlamış, bugünlere kadar da süregelmiştir. Bu çatışmalar sonucunda Kilise, pozitif bilim dünyasını gittikçe dinden uzaklaştırmış ve ateizmin kucağına itmiştir. İslam dünyasında ise bilimle din arasında böyle bir çatışma yaşanmamakla beraber, bilimle din arasında ciddi bir çatlak ve bu günleri de içine alan bir ayrışma meydana gelmiştir. Daha önce medreselerde din bilimleriyle beraber okunan pozitif bilimler, ne hikmettir bilinmez, 1550’lerden sonra medrese programlarından tamamen çıkartılmıştır. Böylece bütün islam dünyasında ayrışma dediğimiz bu olay meydana gelmiştir. Dolayısıyla pozitif bilimlerden tamamen kopuk, dünyadaki bilimsel gelişmelerden tamamen habersiz bugünün geri kalmış Müslüman dünyası oluşmuştur.