Casus, iz bırakmadan ortadan kaybolan bir ajanın hikayesini konu ediyor. Rachel, İsrail’in korkulan ulusal istihbarat örgütü Mossad`ın ajanlarından biridir. Ancak Rachel, babasının Londra’daki cenaze töreninde iz bırakmadan ortadan kaybolur. Rachel`ın nerede olduğu hakkındaki tek ipuçu, Almanya`dan İsrail`e çağırılan eski gözetmeni Thomas`la yaptığı şifreli bir telefon görüşmesidir. Rachel’ın hayatı, İran’ın nükleer programına karşı geniş çaplı bir casusluk girişiminin içinde kaybolmuşken, Thomas hem onu korumak hem de Mossad`ın operasyonlarına ne gibi tehditler oluşturabileceğini belirlemek için Rachel`ın adımlarını geriye doğru izlemelidir.